La definición de nueve de las 15 candidaturas a gobernador y de las postulaciones a diputaciones federales ha abierto un nuevo frente en Morena. En las últimas semanas, varios morenistas han manifestado su inconformidad con los resultados de las encuestas elegidas como método de selección: algunos han acusado "dedazos", "fraude" y "decisiones cupulares", cuatro incluso han renunciado, alrededor de 15 han impugnado ante el Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación (TEPJF) y otros más ya se han incorporado a otras fuerzas políticas.
Para evitar conflictos, Morena previamente pidió a todos los aspirantes a candidaturas que firmaran una carta para que, durante los proceso internos, se comprometieran a no intercambiar señalamientos o acusaciones y, más aún, a aceptar la decisión derivada de las encuestas.