Mientras avanzó el proceso legal de Genaro García Luna en Estados Unidos, acusado de proteger al Cártel de Sinaloa, se giró una orden de aprehensión en contra de uno de sus colaboradores cercanos: Luis Cárdenas Palomino, ex director de Seguridad Regional en la Policía Federal, considerado impulsor de la carrera de García Harfuch.
En 2008, Cárdenas Palomino fue nombrado Coordinador de Inteligencia para la Prevención del Delito de la Policía Federal, ese mismo año Garcia Harfuch ingresó a esa área como Jefe de Departamento, asignado a la División de Gendarmería..
El ascenso de García Harfuch fue veloz al interior de la corporación: fue encargado de grupo en la Dirección General de Tráfico y Contrabando; director de Apoyo Operativo Regional, de la División de Seguridad Regional; coordinador Estatal de la Policía Federal en Guerrero, y titular de la División de Investigación de la PF, pese a que entre 2009 y 2011 reprobó el examen de confianza, de acuerdo con la investigación periodística de Aristegui Noticias ..
En tres ocasiones distintas (enero de 2009, y mayo y octubre de 2011) Garcia Harfuch erró en la prueba de polígrafo a la pregunta “¿mantienes compromisos con la delincuencia organizada?” al registrar “reacciones significativas de falta de veracidad”, según informes de la Dirección General de Control de Confianza de la Policía Federal obtenidos por la periodista Anabel Hernández, autora de la investigación basada en documento oficiales.
El documento exhibido dice textualmente: “NO CUMPLE CON EL PERFIL”.