Estas son la dependencias que pasan a la estructura de la subsecretaría de López-Gatell:
- Centro Nacional de Equidad de Género y Salud Reproductiva.
- Centro Nacional de Programas Preventivos y Control de Enfermedades.
- Centro Nacional para la Prevención y el Control del VIH/SIDA.
- Centro Nacional para la Salud de la Infancia y la Adolescencia.
- Centro Nacional de la Transfusión Sanguínea.
- Servicios de Atención Psiquiátrica.
- Dirección General de Epidemiología.
- Dirección General de Promoción de la Salud.
- Dirección General de Información en Salud.
- Secretariado Técnico del Consejo Nacional de Salud Mental.
- Secretariado Técnico del Consejo Nacional para la Prevención de Accidentes.
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El acuerdo también establece que bajo la dirección del secretario de Salud quedarán adscritas las siguientes unidades administrativas y órganos desconcentrados:
- Subsecretaría de Integración y Desarrollo del Sector Salud
- Comisión Nacional de Arbitraje Médico.
- Comisión Nacional de Bioética.
- Oficina del Abogado General.
- Unidad Coordinadora de Vinculación y Participación Social.
- Dirección General de Comunicación Social.
- Dirección General de Relaciones Internacionales.
- Dirección General de Políticas de Investigación en Salud.
- Secretariado Técnico del Consejo Nacional de Salud.