Además, enfatizó que "nunca en ningún gobierno, un militar ha interrogado a un civil" que encabezó los trabajos de una Comisión de la Verdad ni tampoco se había registrado que una dependencia del Ejecutivo Federal, como es la Fiscalía de Justicia Militar, ejerza acciones en contra del titula de otra institución del mismo Poder Ejecutivo.
“Durante la audiencia, a pregunta expresa de la jueza Duarte Cedillo, el Mayor de Justicia Militar Jorge Alfredo Rico Pérez declaró haber iniciado una demanda en mi contra en la Fiscalía General de la República cuando estaba aún en funciones como Subsecretario de Derechos Humanos de la Secretaría de Gobernación, lo que evidenció que el propósito de la promoción de esa audiencia era buscar mi autoincriminación”, dijo.
Cuando Alejandro Encinas fue subsecretario de Derechos Humanos, Población y Migración instaló por Decreto Presidencial la Comisión para la Verdad y Acceso a la Justicia del Caso Ayotzinapa en enero de 2019.