Actualmente, hay tres rutas que operan en los estados de Baja California, Chihuahua-Sinaloa y Jalisco.
El Chepe
En aproximadamente nueve horas, se recorre en tren más de 350 km saliendo de Los Mochis, Sinaloa hacia Creel, Chihuahua, Pueblo Mágico ubicado en el corazón de la Sierra Tarahumara, zona también conocida como Las Barrancas del Cobre, que son una serie de imponentes cañones que unen a estos dos estados del norte de México.
Tequila Express
El recorrido de este tren va de Guadalajara a Tequila, haciendo la conocida como ‘ruta del tequila’. El trayecto es de aproximadamente dos horas.
Tijuana-Tecate
Esta ruta va desde Tijuana hasta el Pueblo Mágico de Tecate. El tren tiene capacidad para 280 personas y el recorrido tiene una duración de dos horas y media. Entre las paradas de éste se encuentran: Presa Abelardo L. Rodríguez, Valle de Guadalupe y el parque Miguel Hidalgo, en el Pueblo Mágico de Tecate.
La despedida del tren en Puebla
Hasta 2021 había otra ruta de tren de pasajeros en operación en México y estaba en Puebla. Se trataba del Tren Turístico Puebla-Cholula , el cual dio su último recorrido en diciembre del año pasado.